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PubChemQC

PubChemQCは、PubChemに収録されている化合物の量子化学計算に基づいて構築された化学構造の最適化に特化したデータベースである。量子化学的手法を用いた化合物の構造最適化データを提供し、化合物の最適化された幾何学…続きを読む

材料解析のためのオープンソースPythonライブラリ。Materials ProjectやCrystallography Open Database等の外部データソースとの連携を特徴としており、APIを通して構造データな…続きを読む

PyTorchは、ディープラーニングの研究と開発を目的としたオープンソースの機械学習ライブラリである。FacebookのAIリサーチチームによって開発され、Pythonとの親和性が高く、動的計算グラフを採用しているのが特…続きを読む

RadonPyは全原子分子動力学(MD)シミュレーションにより、ポリマーの物性を計算するためのPythonライブラリ。高分子の繰り返し単位とその化学構造、重合度、温度等の計算条件を入力とし、分子モデリング、電荷計算、平衡…続きを読む

国内の物質・材料についての研究データを登録し、構造化された形でクラウド上に保持する事が可能なシステム。実験、計測、数値計算等で日々生まれる生データは、そのままの形では再利用や他グループとのデータ共有が難しい。RDEは生デ…続きを読む

RDKitは、化学情報学や分子モデリングを支援するために開発された、オープンソースのライブラリである。C++で実装されながらもPythonをはじめとする複数の言語バインディングが用意されており、SMILESやSDFなどの…続きを読む

RNAPSEC（RNAPhaSep with detailed Experimental Conditions）は、タンパク質とRNAが液-液相分離（LLPS）を引き起こす詳細な条件を収録したデータセットである。LLPS…続きを読む

SciFinder-nは、Chemical Abstracts Serviceによって提供される先進的な科学研究ツールである。この包括的なデータベースは、科学論文、特許、化合物データ、反応、実験手順などへのアクセスを可能…続きを読む

SIMPLE-NNはベーラー・パリネロ型ニューラルネットワークポテンシャルを実装するソフトウェアパッケージである。構造とエネルギー・原子間力・応力の第一原理計算のデータからをポテンシャルを学習したり、学習済みのポテンシャ…続きを読む

SMILES-Xは、分子のSMILESのみを入力として物理化学的性質、例えば溶解度や水和自由エネルギー、リポフィリシティなどの特性を予測するための自動パイプラインである。このツールは、人間が設計した記述子を必要とせず、特…続きを読む