DB・解析ツール一覧

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TOAST

ハイスループットな電子構造計算を自動実行するためのPythonベースのフレームワーク。CIFファイルからの第一原理計算の入力ファイルへの変換、ジョブスクリプトの生成、ジョブ起動、データ解析と後処理のためのライブラリが実装続きを読む

UniProt

UniProtは、タンパク質に関する広範囲のデータを提供する包括的なリソースである。このデータベースは、数千種類の生物から得られたタンパク質のアミノ酸配列、生物学的機能、遺伝子情報、および可能な場合には三次元構造情報を含続きを読む

WebPlotDigitizer

WebPlotDigitizerは、グラフやプロットからデータを抽出するためのツールである。多くの研究者やプロフェッショナルが印刷された文献や報告書から数値データを取得する際の課題を解決するために開発された。このツールは続きを読む

XDS

XDS(X-ray Detector Software)は、X線結晶構造解析に使用されるデータ処理ソフトウェアであり、X線回折データのインデックス付け、統合、スケーリングを行い、結晶構造解析のためのデータセットを生成する続きを読む

XenonPy

マテリアルズインフォマティクスのための機械学習ツールが実装されたPythonライブラリ。組成・構造・RDKit記述子を用い材料記述子を算出するライブラリを提供している。記述子と目的とする特性との相関を捉えやすくするよう、続きを読む

Zenodo

全学術領域にまたがり、テキストやスプレッドシート、音声、動画等フォーマットを問わず、研究者の研究成果を登載され、DOIが付与され、共有することができるオープンリポジトリ。GitHubアカウントまたはORCID iDでのロ続きを読む