RNAPSEC(RNAPhaSep with detailed Experimental Conditions)は、タンパク質とRNAが液-液相分離(LLPS)を引き起こす詳細な条件を収録したデータセットである。LLPS…続きを読む
DB・解析ツール一覧
SciFinder-n
SciFinder-nは、Chemical Abstracts Serviceによって提供される先進的な科学研究ツールである。この包括的なデータベースは、科学論文、特許、化合物データ、反応、実験手順などへのアクセスを可能…続きを読む
SIMPLE-NN
SIMPLE-NNはベーラー・パリネロ型ニューラルネットワークポテンシャルを実装するソフトウェアパッケージである。構造とエネルギー・原子間力・応力の第一原理計算のデータからをポテンシャルを学習したり、学習済みのポテンシャ…続きを読む
SMILES-X
SMILES-Xは、分子のSMILESのみを入力として物理化学的性質、例えば溶解度や水和自由エネルギー、リポフィリシティなどの特性を予測するための自動パイプラインである。このツールは、人間が設計した記述子を必要とせず、特…続きを読む
Spider Silkome Database
Spider Silkome Databaseは、蜘蛛の糸に関連するデータに特化したデータベースである。このデータベースは、蜘蛛の糸を構成するタンパク質のアミノ酸配列、それをコードする遺伝子、および引張強度、伸縮性、耐久…続きを読む
Spyder
Spyderは、Pythonプログラミングに特化した統合開発環境であり、科学計算やデータ分析を行うための強力なツールである。使いやすいコードエディタ、リアルタイムの変数エクスプローラー、統合IPythonコンソール、デバ…続きを読む
Starrydata
熱電材料、磁性材料、強誘電体に関するデータベース。論文に掲載されたグラフ画像を読み込み数値データに自動変換する事で効率的にデータを収集しており、データの意味(ラベル)も入力されている。特定のデータに偏らないよう、特性の良…続きを読む
Thermo-calc
Thermo-Calcは,CALPHAD法(Calculation of Phase Diagrams)を基にした平衡計算ソフトウェアである.金属,セラッミック,混合塩などの無機材料の分野で広く活用されている.多元系の相…続きを読む
TOAST
ハイスループットな電子構造計算を自動実行するためのPythonベースのフレームワーク。CIFファイルからの第一原理計算の入力ファイルへの変換、ジョブスクリプトの生成、ジョブ起動、データ解析と後処理のためのライブラリが実装…続きを読む
TURBOMOLE
TURBOMOLEは、ドイツのカールスルーエ工科大学で開発された、高精度かつ高速な電子構造計算を実現する量子化学ソフトウェアである。Hartree-FockやDFTからMP2、CC2、CCSD(T)など多彩な計算手法に対…続きを読む