list | Page 6 of 8 | MatDaCs

PHYSBO

高速でスケーラブルなベイズ最適化 (Bayesian optimization) のためのPythonライブラリ。できるだけ少ない実験・シミュレーション回数で、目的関数値(材料特性など)が良くなるパラメータ(材料の組成、…続きを読む

高分子材料設計にかかわる基礎的なデータを収録するデータベース。物質・材料データベースMatNaviのひとつとして、NIMSが提供している。2万件以上の学術文献から高分子材料設計にかかわるデータを収集しており、IUPAC準…続きを読む

生体高分子（タンパク質、DNA、RNA、糖鎖など）の立体構造データとそのメタデータを集めたデータベース。X線結晶解析法やNMR法（核磁気共鳴法）、クライオ電子顕微鏡法、X線・中性子ハイブリッド法などの認定された実験手法に…続きを読む

PubChemは、化学物質、生物活性、化学反応に関する情報を提供する無料のデータベースであり、アメリカ国立衛生研究所の国立生物工学情報センターによって管理されている。数百万の化学物質に関する広範なデータが含まれており、識…続きを読む

PubChemQCは、PubChemに収録されている化合物の量子化学計算に基づいて構築された化学構造の最適化に特化したデータベースである。量子化学的手法を用いた化合物の構造最適化データを提供し、化合物の最適化された幾何学…続きを読む

材料解析のためのオープンソースPythonライブラリ。Materials ProjectやCrystallography Open Database等の外部データソースとの連携を特徴としており、APIを通して構造データな…続きを読む

PyTorchは、ディープラーニングの研究と開発を目的としたオープンソースの機械学習ライブラリである。FacebookのAIリサーチチームによって開発され、Pythonとの親和性が高く、動的計算グラフを採用しているのが特…続きを読む

RadonPyは全原子分子動力学(MD)シミュレーションにより、ポリマーの物性を計算するためのPythonライブラリ。高分子の繰り返し単位とその化学構造、重合度、温度等の計算条件を入力とし、分子モデリング、電荷計算、平衡…続きを読む

国内の物質・材料についての研究データを登録し、構造化された形でクラウド上に保持する事が可能なシステム。実験、計測、数値計算等で日々生まれる生データは、そのままの形では再利用や他グループとのデータ共有が難しい。RDEは生デ…続きを読む

RDKitは、化学情報学や分子モデリングを支援するために開発された、オープンソースのライブラリである。C++で実装されながらもPythonをはじめとする複数の言語バインディングが用意されており、SMILESやSDFなどの…続きを読む