DB・解析ツール一覧

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Spider Silkome Database

Spider Silkome Databaseは、蜘蛛の糸に関連するデータに特化したデータベースである。このデータベースは、蜘蛛の糸を構成するタンパク質のアミノ酸配列、それをコードする遺伝子、および引張強度、伸縮性、耐久続きを読む

Spyder

Spyderは、Pythonプログラミングに特化した統合開発環境であり、科学計算やデータ分析を行うための強力なツールである。使いやすいコードエディタ、リアルタイムの変数エクスプローラー、統合IPythonコンソール、デバ続きを読む

Starrydata

熱電材料、磁性材料、強誘電体に関するデータベース。論文に掲載されたグラフ画像を読み込み数値データに自動変換する事で効率的にデータを収集しており、データの意味(ラベル)も入力されている。特定のデータに偏らないよう、特性の良続きを読む

Thermo-calc

Thermo-Calcは,CALPHAD法(Calculation of Phase Diagrams)を基にした平衡計算ソフトウェアである.金属,セラッミック,混合塩などの無機材料の分野で広く活用されている.多元系の相続きを読む

TOAST

ハイスループットな電子構造計算を自動実行するためのPythonベースのフレームワーク。CIFファイルからの第一原理計算の入力ファイルへの変換、ジョブスクリプトの生成、ジョブ起動、データ解析と後処理のためのライブラリが実装続きを読む

TURBOMOLE

TURBOMOLEは、ドイツのカールスルーエ工科大学で開発された、高精度かつ高速な電子構造計算を実現する量子化学ソフトウェアである。Hartree-FockやDFTからMP2、CC2、CCSD(T)など多彩な計算手法に対続きを読む

UniProt

UniProtは、タンパク質に関する広範囲のデータを提供する包括的なリソースである。このデータベースは、数千種類の生物から得られたタンパク質のアミノ酸配列、生物学的機能、遺伝子情報、および可能な場合には三次元構造情報を含続きを読む

WebPlotDigitizer

WebPlotDigitizerは、グラフやプロットからデータを抽出するためのツールである。多くの研究者やプロフェッショナルが印刷された文献や報告書から数値データを取得する際の課題を解決するために開発された。このツールは続きを読む

XDS

XDS(X-ray Detector Software)は、X線結晶構造解析に使用されるデータ処理ソフトウェアであり、X線回折データのインデックス付け、統合、スケーリングを行い、結晶構造解析のためのデータセットを生成する続きを読む

XenonPy

マテリアルズインフォマティクスのための機械学習ツールが実装されたPythonライブラリ。組成・構造・RDKit記述子を用い材料記述子を算出するライブラリを提供している。記述子と目的とする特性との相関を捉えやすくするよう、続きを読む