DB・解析ツール一覧

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2DMAT

2DMATは,順問題ソルバーに対して探索アルゴリズムを適用して最適解を探すためのフレームワークである. 順問題ソルバーはユーザー自身で定義することができ、標準的な順問題ソルバーとしては2次元物質構造解析向け実験データ解析続きを読む

AAindex

AAindexは、タンパク質のアミノ酸配列に関連する生物物理的および化学的特性を集めたデータベースである。アミノ酸の水溶性、疎水性、電荷、大きさ、形状などの物理化学的特性に関するデータを提供し、タンパク質の機能、立体構造続きを読む

AFLOWpi

ハイスループット第一原理計算を実行するためのPythonフレームワーク。フォノン分散、弾性特性、拡散輸送係数などを第一原理的に計算するには大規模な計算セットを必要とし、AFLOWpiはこのような計算を管理する事を目的とし続きを読む

AiiDA

計算タスクやデータの管理を支援するためのオープンソースのPythonライブラリ。計算の入力、出力、メタデータの履歴を記録する事が可能。これによってハイスループット計算を実行してシステマティックなデータベースの生成が可能。続きを読む

atomate

材料計算の自動化のためのオープンソースライブラリ。構造最適化、バンド構造、電子輸送特性、誘電率など幅広い材料特性を計算するための標準ワークフローが用意されており、結晶構造を与えるだけでこれらが利用出来る。計算パラメータの続きを読む

AtomWork-Adv

無機材料の結晶構造、X線回折、各種特性(電子・電気特性、磁気特性、機械的特性、光学特性、相変態、超電導特性、熱・熱力学特性)、状態図に関して、約1000種類のジャーナルから抽出し、収録したデータベース。検索機能が充実して続きを読む

Cambridge Structure Database (CSD)

ケンブリッジ結晶学センター(CCDC)が運営する低分子有機・有機金属結晶構造のデータベース。2023年2月現在、120万を超える構造が登録されており、構造をCIFファイルの形式で取得できるほか、WEB上で3次元構造、2次続きを読む

ChEMBL

ChEMBLは、生物学的に活性な化合物に関する包括的なデータベースであり、薬剤発見と開発において重要なリソースである。このデータベースには、薬理学的ターゲット、化合物の活性データ、薬物構造、薬物標的の相互作用などの幅広い続きを読む

COMPARED

COMPARED(COMPutation ARchive of Exact Diagonalization)は、厳密対角化法を使用した量子格子モデルソルバーHΦの網羅的な計算結果を格納するデータベースである。厳密対角化法続きを読む

CompES-X

電子構造データを収録しているデータベース。NIMSが提供する物質・材料データベースMatNaviに含まれている。無機材料データベースAtomWorkに収録されているCIFファイルを元にして第一原理計算ソフトウェアVASP続きを読む