レビュー

MatDaCs ツールレビュー: ASE(Atomic Simulation Environment)

概要 ASEは、原子シミュレーションの構築・実行・解析の手順を標準化するPythonツールキットである。共通のAtomsオブジェクトとCalculatorインターフェースを定義し、複数の電子状態計算エンジンや力場エンジン続きを読む

MatDaCs Tool Review: MODNet

概要 MODNet(Material Optimal Descriptor Network)は、matminer記述子と相互情報量に基づく特徴選択、さらにjoint learningを組み合わせ、小規模またはノイズのある続きを読む

MatDaCs ツールレビュー: Matminer

概要 Matminerは、データセット取得、特徴量エンジニアリング、pandasユーティリティを統合し、構造データから機械学習モデルまでを素早くつなぐ材料インフォマティクス向けツールキットである。本レビューでは、macO続きを読む

MatDaCs ツールレビュー: MAST-ML

概要 MAST-ML(Materials Simulation Toolkit for Machine Learning)は、材料研究向けの教師あり学習ツールキットであり、Jupyterノートブックとチュートリアル主導の続きを読む

MatDaCsツール試用レポート: DScribe

概要 DScribeは、材料科学向け機械学習で用いる原子環境記述子を高速に生成できるPythonパッケージである。本レビューでは、Cu(111)表面の吸着サイト解析と小分子の構造類似度評価を通じて、DScribeの特徴・続きを読む

MatDaCs ツールレビュー: CrabNet

概要 CrabNetは、化学式のみを入力としてTransformer系の注意機構を材料インフォマティクスに適用するモデルである。本レビューでは、pip最新版(2.0.8)をmacOS(Apple M4 Pro)に導入し、続きを読む

MatDaCs ツールレビュー: CDVAE

概要 CDVAEは、結晶構造を対象とする拡散モデルベースの変分オートエンコーダである。材料の生成・再構成・物性条件付き設計を狙い、Perov-5、Carbon-24、MP-20などの整理されたデータセットと、学習/評価ユ続きを読む

MatDaCs ツールレビュー: cclib

概要 cclibは計算化学のログファイルをパースするためのツールキットである。量子化学コードごとに異なる出力から、信頼できる構造化データを抽出するという実務上の課題に対し、統一APIを提供し、解析・可視化ツールへの橋渡し続きを読む

DyRAMO: 生成AIによる信頼度の高い分子設計

概要図 図1: DyRAMO(Dynamic Reliability Adjustment for Multi-objective Optimization)による適切な信頼度探索の枠組み 研究のポイント(着眼点) 従来続きを読む

CrySpyの使い方

1. はじめに CrySPYは結晶の組成を与えると構造を探索し構造最適化をすることができるソフトウェアです。構造のエネルギー評価には第一原理計算や分子動力学のソフトウェアを使用します。ここではDocker版のMateri続きを読む