DB・解析ツール一覧

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COMPARED

COMPARED(COMPutation ARchive of Exact Diagonalization)は、厳密対角化法を使用した量子格子モデルソルバーHΦの網羅的な計算結果を格納するデータベースである。厳密対角化法続きを読む

CompES-X

電子構造データを収録しているデータベース。NIMSが提供する物質・材料データベースMatNaviに含まれている。無機材料データベースAtomWorkに収録されているCIFファイルを元にして第一原理計算ソフトウェアVASP続きを読む

CompoTherm

複合材料熱物性予測システム。構造タイプを指定し、材料となるそれぞれの物質の物性値を入力する。これにより生成される複合材料の熱伝導率、熱拡散係数などの熱物性のデータが出力される。ブラウザ経由で使用可能。続きを読む

CrysAlisPro

CrysAlisProは、Rigaku Oxford Diffractionによって提供される単結晶X線回折データの収集、処理、および構造解析を行うためのソフトウェアである。このソフトウェアは、小分子およびタンパク質結晶続きを読む

CrySpy

結晶構造探索を行うためのオープンソースソフトウェア。結晶の組成を与えるだけで、構造の探索を実行し、構造最適化をする。与えられた構造のエネルギー評価には第一原理計算や分子動力学の外部ソフトウェアを使用する。探索アルゴリズム続きを読む

Crystallography Open Database (COD)

生体高分子以外の有機、無機、有機金属化合物、鉱物の結晶構造を収録したオープンアクセスのデータベース。2023年2月現在で約50万の構造データが含まれている。化学式、組成、空間群などから候補を絞り込む事が出来、物質構造の情続きを読む

DBKERO

DBKERO(Database of Kashiwa Encyclopedia for Researches of multi-Omics data)は、ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトームなどの多様なオミックスデー続きを読む

Dryad

研究領域やファイルフォーマットを問わず、プロジェクトのデータを共有できるオープンリポジトリ。登録するとDOIが自動で付与される。独立した非営利組織によって運営されており、研究者、出版社、研究機関と連携してデータセットを公続きを読む

Expasy

Expasy(Expert Protein Analysis System)は、スイス生物情報学研究所(SIB Swiss Institute of Bioinformatics)によって運営される、生物学およびバイオイ続きを読む

Figshare

論文や図表、データセット等を公開するためのデータリポジトリ。分野は限定されていないものの、生物系の分野のデータが多く含まれている。登録した研究者がデータをクラウド上にアップロードし、公開、共有する事が可能。引用のためのD続きを読む