DB・解析ツール一覧

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Expasy

Expasy(Expert Protein Analysis System)は、スイス生物情報学研究所(SIB Swiss Institute of Bioinformatics)によって運営される、生物学およびバイオイ続きを読む

Figshare

論文や図表、データセット等を公開するためのデータリポジトリ。分野は限定されていないものの、生物系の分野のデータが多く含まれている。登録した研究者がデータをクラウド上にアップロードし、公開、共有する事が可能。引用のためのD続きを読む

FireWorks

ハイスループット計算などのワークフローを定義、管理、実行するためのオープンソースコード。ワークフローはPython, JSON, YAMLで定義し、MongoDBに保存される。内蔵のWebインターフェースを用いたワークフ続きを読む

FLARE (Fast Learning of Atomistic Rare Events)

このコードは、ガウス過程手法に基づいて機械学習用の原子間ポテンシャルを作成することを目的としている。そのポテンシャルは、LAMMPSやASEなどのMDエンジンと組み合わせて使用可能である。ガウス過程自体は、回帰タスクに適続きを読む

Fluent

Fluentは流体の流れ、熱・物質輸送、化学反応などのシミュレーションを実現する多様な物理モデルを搭載した汎用の数値流体力学(CFD)ソフトウェアである。乱流モデリング、単相流および混相流、燃焼、バッテリモデリング、流体続きを読む

HALCON

HALCONは、産業用画像処理のための包括的なソフトウェアパッケージであり、ドイツのMVTec Software GmbHによって開発されている。このソフトウェアは、オブジェクトの識別、分類、測定、検査などのための高度な続きを読む

ICSD

FIZカールスルーエが運営する無機材料のデータベース。26万以上の結晶構造を収録しており、毎年、約12,000の構造が追加されている。X線解析による鉱物・セラミックス・金属間化合物などが収録されており、これらについてCI続きを読む

Igor Pro

Igor Proは、WaveMetrics社によって開発されたデータ解析およびグラフ作成のためのソフトウェアであり、統計的分析、信号処理、画像処理などの幅広いデータ解析機能を提供する。高品質なグラフィックスとグラフを作成続きを読む

ImageJ

ImageJは、アメリカ国立衛生研究所(NIH)によって開発されたオープンソースのJavaベースの画像処理ソフトウェアであり、生物学や医学研究をはじめとする科学的画像データの解析に広く使用されている。このプラットフォーム続きを読む

iqspr

目的の物理化学的特性から新規有機化合物を生成するためのライブラリ。ポリマーの構造から特性を導き出す機械学習モデルを基に、入力された特性から候補物質を予測する逆問題のモデルを作成する。 欲しい特性を入力すると、作成したモデ続きを読む