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CrySPY

結晶構造探索を行うためのオープンソースソフトウェア。結晶の組成を与えるだけで、構造の探索を実行し、構造最適化をする。与えられた構造のエネルギー評価には第一原理計算や分子動力学の外部ソフトウェアを使用する。探索アルゴリズム…続きを読む

生体高分子以外の有機、無機、有機金属化合物、鉱物の結晶構造を収録したオープンアクセスのデータベース。2023年2月現在で約50万の構造データが含まれている。化学式、組成、空間群などから候補を絞り込む事が出来、物質構造の情…続きを読む

DBKERO（Database of Kashiwa Encyclopedia for Researches of multi-Omics data）は、ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトームなどの多様なオミックスデー…続きを読む

DEFORMは、鍛造、圧延、切削、熱処理などの製造プロセスを高精度にシミュレーションするためのCAEソフトウェアである。有限要素法（FEM）を用いた塑性変形解析により、材料の流れや応力・ひずみ分布、温度変化を詳細に予測し…続きを読む

研究領域やファイルフォーマットを問わず、プロジェクトのデータを共有できるオープンリポジトリ。登録するとDOIが自動で付与される。独立した非営利組織によって運営されており、研究者、出版社、研究機関と連携してデータセットを公…続きを読む

Expasy（Expert Protein Analysis System）は、スイス生物情報学研究所（SIB Swiss Institute of Bioinformatics）によって運営される、生物学およびバイオイ…続きを読む

FactSageは、化学熱力学の計算とデータ解析を支援する統合ソフトウェアであり、世界最大級の熱力学データベースと平衡計算機能を備えている。材料科学、製錬、腐食、燃焼、セラミックス、地質学など幅広い分野で利用され、数千種…続きを読む

論文や図表、データセット等を公開するためのデータリポジトリ。分野は限定されていないものの、生物系の分野のデータが多く含まれている。登録した研究者がデータをクラウド上にアップロードし、公開、共有する事が可能。引用のためのD…続きを読む

ハイスループット計算などのワークフローを定義、管理、実行するためのオープンソースコード。ワークフローはPython, JSON, YAMLで定義し、MongoDBに保存される。内蔵のWebインターフェースを用いたワークフ…続きを読む

このコードは、ガウス過程手法に基づいて機械学習用の原子間ポテンシャルを作成することを目的としている。そのポテンシャルは、LAMMPSやASEなどのMDエンジンと組み合わせて使用可能である。ガウス過程自体は、回帰タスクに適…続きを読む