Optunaは、ハイパーパラメータの最適化を効率的に行うためのPythonライブラリである。データ駆動科学では、このような最適化作業は不可欠なステップであり、そのニーズを満たすツールとして利用されている。主に数値、カテゴ…続きを読む
DB・解析ツール一覧
PANDAT
PANDATは、物質科学と工学の分野で使用されるソフトウェアツールであり、合金の相図計算と材料設計に特化している。合金系の相図と熱力学的性質を計算する機能を備え、液相、固相、気相などの相の安定性と形成に関する情報を提供す…続きを読む
PHYSBO
高速でスケーラブルなベイズ最適化 (Bayesian optimization) のためのPythonライブラリ。できるだけ少ない実験・シミュレーション回数で、目的関数値(材料特性など)が良くなるパラメータ(材料の組成、…続きを読む
PolyInfo
高分子材料設計にかかわる基礎的なデータを収録するデータベース。物質・材料データベースMatNaviのひとつとして、NIMSが提供している。2万件以上の学術文献から高分子材料設計にかかわるデータを収集しており、IUPAC準…続きを読む
Protein Data Bank (PDB)
生体高分子(タンパク質、DNA、RNA、糖鎖など)の立体構造データとそのメタデータを集めたデータベース。X線結晶解析法やNMR法(核磁気共鳴法)、クライオ電子顕微鏡法、X線・中性子ハイブリッド法などの認定された実験手法に…続きを読む
PubChem
PubChemは、化学物質、生物活性、化学反応に関する情報を提供する無料のデータベースであり、アメリカ国立衛生研究所の国立生物工学情報センターによって管理されている。数百万の化学物質に関する広範なデータが含まれており、識…続きを読む
PubChemQC
PubChemQCは、PubChemに収録されている化合物の量子化学計算に基づいて構築された化学構造の最適化に特化したデータベースである。量子化学的手法を用いた化合物の構造最適化データを提供し、化合物の最適化された幾何学…続きを読む
pymatgen
材料解析のためのオープンソースPythonライブラリ。Materials ProjectやCrystallography Open Database等の外部データソースとの連携を特徴としており、APIを通して構造データな…続きを読む
PyTorch
PyTorchは、ディープラーニングの研究と開発を目的としたオープンソースの機械学習ライブラリである。FacebookのAIリサーチチームによって開発され、Pythonとの親和性が高く、動的計算グラフを採用しているのが特…続きを読む
RDE
国内の物質・材料についての研究データを登録し、構造化された形でクラウド上に保持する事が可能なシステム。実験、計測、数値計算等で日々生まれる生データは、そのままの形では再利用や他グループとのデータ共有が難しい。RDEは生デ…続きを読む