DB・解析ツール一覧

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Cambridge Structure Database (CSD)

ケンブリッジ結晶学センター(CCDC)が運営する低分子有機・有機金属結晶構造のデータベース。2023年2月現在、120万を超える構造が登録されており、構造をCIFファイルの形式で取得できるほか、WEB上で3次元構造、2次続きを読む

ChatGPT

ChatGPTは、OpenAIによって開発された大規模言語モデルであり、自然言語処理において優れた能力を持つ人工知能である。ユーザーとの対話を通じて、幅広いトピックに関する質問に答えたり、文章生成や翻訳、テキスト要約など続きを読む

ChEMBL

ChEMBLは、生物学的に活性な化合物に関する包括的なデータベースであり、薬剤発見と開発において重要なリソースである。このデータベースには、薬理学的ターゲット、化合物の活性データ、薬物構造、薬物標的の相互作用などの幅広い続きを読む

ChIP-Atlas

ChIP-Atlasは、公開されているChIP-seq(クロマチン免疫沈降シーケンシング)データを統合し、可視化するオープンアクセスデータベースである。様々な種や条件下でのタンパク質-DNA相互作用やエピジェネティックな続きを読む

COMPARED

COMPARED(COMPutation ARchive of Exact Diagonalization)は、厳密対角化法を使用した量子格子モデルソルバーHΦの網羅的な計算結果を格納するデータベースである。厳密対角化法続きを読む

CompES-X

電子構造データを収録しているデータベース。NIMSが提供する物質・材料データベースMatNaviに含まれている。無機材料データベースAtomWorkに収録されているCIFファイルを元にして第一原理計算ソフトウェアVASP続きを読む

CompoTherm

複合材料熱物性予測システム。構造タイプを指定し、材料となるそれぞれの物質の物性値を入力する。これにより生成される複合材料の熱伝導率、熱拡散係数などの熱物性のデータが出力される。ブラウザ経由で使用可能。続きを読む

CrysAlisPro

CrysAlisProは、Rigaku Oxford Diffractionによって提供される単結晶X線回折データの収集、処理、および構造解析を行うためのソフトウェアである。このソフトウェアは、小分子およびタンパク質結晶続きを読む

CrySpy

結晶構造探索を行うためのオープンソースソフトウェア。結晶の組成を与えるだけで、構造の探索を実行し、構造最適化をする。与えられた構造のエネルギー評価には第一原理計算や分子動力学の外部ソフトウェアを使用する。探索アルゴリズム続きを読む

Crystallography Open Database (COD)

生体高分子以外の有機、無機、有機金属化合物、鉱物の結晶構造を収録したオープンアクセスのデータベース。2023年2月現在で約50万の構造データが含まれている。化学式、組成、空間群などから候補を絞り込む事が出来、物質構造の情続きを読む