AAindexは、タンパク質のアミノ酸配列に関連する生物物理的および化学的特性を集めたデータベースである。アミノ酸の水溶性、疎水性、電荷、大きさ、形状などの物理化学的特性に関するデータを提供し、タンパク質の機能、立体構造…続きを読む
DB・解析ツール一覧
AFLOWpi
ハイスループット第一原理計算を実行するためのPythonフレームワーク。フォノン分散、弾性特性、拡散輸送係数などを第一原理的に計算するには大規模な計算セットを必要とし、AFLOWpiはこのような計算を管理する事を目的とし…続きを読む
AiiDA
計算タスクやデータの管理を支援するためのオープンソースのPythonライブラリ。計算の入力、出力、メタデータの履歴を記録する事が可能。これによってハイスループット計算を実行してシステマティックなデータベースの生成が可能。…続きを読む
atomate
材料計算の自動化のためのオープンソースライブラリ。構造最適化、バンド構造、電子輸送特性、誘電率など幅広い材料特性を計算するための標準ワークフローが用意されており、結晶構造を与えるだけでこれらが利用出来る。計算パラメータの…続きを読む
AtomWork-Adv
無機材料の結晶構造、X線回折、各種特性(電子・電気特性、磁気特性、機械的特性、光学特性、相変態、超電導特性、熱・熱力学特性)、状態図に関して、約1000種類のジャーナルから抽出し、収録したデータベース。検索機能が充実して…続きを読む