Spacier

Spacierは特に高分子の分野における分子空間データのデータ探索と解析のためのツールを提供するPythonパッケージ。期待改善量(EI)、Probability of Improvement(PI)、期待超体積改善量(EHVI)などの様々なサンプリング手法や、ベイズ最適化(BO)などの最適化手法が利用可能。計算後には、RadonPyシミュレーションの計算ジョブの各種キューイングシステムへの投入スクリプトを用意する。

基本情報

公式サイト https://github.com/s-nanjo/Spacier
公開度 ★★★
マニュアルページ https://github.com/s-nanjo/Spacier?tab=readme-ov-file#usage
ダウンロードページ https://github.com/s-nanjo/Spacier?tab=readme-ov-file#installation
ライセンス

BSD 3-Clause License

開発者

南條舜(総合研究大学院大学), Arifin(JSR株式会社、RDテクノロジー・デジタル変革センター)

対応OS・利用環境

– Python 3.8+

– pip (Python package manager)

関連論文

Shun Nanjo, Arifin, Hayato Maeda, Yoshihiro Hayashi, Kan Hatakeyama-Sato, Ryoji Himeno, Teruaki Hayakawa, Ryo Yoshida, “SPACIER: on-demand polymer design with fully automated all-atom classical molecular dynamics integrated into machine learning pipelines”

npj Computational Materials volume 11, Article number: 16 (2025)